"La muerte de Minato"

Después de que Kakashi se une a los ANBU, Minato le pide a el y al resto del escuadrón estar atento a posibles ataques con el fin de quebrantar la paz que se acaba de lograr, poco después guardias de Konoha son atacados por ninjas de Iwagakure que finalmente son acabados por Kakashi. Por otra parte Kushina se entera de que esta embarazada y se lo revela a Minato el cual le pide a Kakashi ser el guardaespaldas en secreto de esta hasta el momento del parto, así pasados los meses el nacimiento de Naruto esta cerca donde Tobi interfiere e invoca al Kyūbi destruyendo Konoha, Kakashi y los otros son llevados donde no interferirán. Después de que Minato y Kushina logran sellar al Bijū, Hiruzen llega promete hacerse cargo de Naruto. Días después el funeral de Minato y los demás shinobis caídos se lleva a cabo, una nueva reunion se lleva a cabo para elegir al siguiente Hokage pero Hiruzen decide hacerse cargo y dar tiempo a los futuros ninjas. Después de ello Danzō le pide a Kakashi ser su seguidor. 

Opcion 2

"La máscara que oculta el corazón"

Opcion 2

"Renacimiento: 'Akatsuki'"

La organización Akatsuki logra hacer un acuerdo con Hanzō para la paz en Amekagure, pero es una trampa para acabar con Yahiko el cual es el líder, los demas miembros de Akatsuki salen en su ayuda pero Obito y Zetsu aparecen y acaban con todos, tras reunirse Hanzō y Yahiko, este le pide a Nagato matar a su líder ya que Konan fue capturada, tras la muerte de su amigo, Nagato invoca al Gedō Mazō donde acaba con todos los subordinados de Hanzō, así después de ello la nueva Akatsuki nace donde Yahiko con el Rinnegan se convierte en el primer camino del dolor. 

"Una sombra que se arrastra"

En Konoha el joven Kakashi le pregunta a Jiraiya acerca de los tres huérfanos de la lluvia, ante esto el Sannin le habla acerca de cada uno cuando el fue su maestro hace tantos años, allí este recuerda cuando le hablo a Nagato a cerca de conseguir la paz mundial, mientras que en Amekagure la naciente Akatsuki sigue dando el mensaje de la paz sin la violencia, cuando se cruzan por una aldea devastada y confirmar que han sido shinobis de la Aldea de la Roca, Yahiko, Nagato y Konan deciden hablar con los responsables pero en el camino son atacados allí Nagato pierde el control y ante el temor de perder a sus amigos libera al Gedō Mazō el cual acaba con los shinobis enemigos y este cae inconsciente. Después de ello Danzō que observo la pelea decide llevarle los cuerpos caídos a Hanzō y hacerle creer que Akatsuki hará un golpe de estado y controlar toda la aldea. 

Opcion 2

"Mundo de los sueños"

Una vez que Obito logra acabar con los shinobis enemigos, se acerca al cuerpo de Rin sin vida donde tras llorar, recuerda las palabras de Madara acerca del mundo que desea crear donde todo el mundo vivirá en paz, de vuelta en el escondite, le pide a Madara que le explique el plan de sumir a todo el mundo, Madara entonces usa su Genjutsu y le explica que a través de los poderes Uchiha y Senju logro despertar el Rinnegan y así obtener la muda del Jūbi al que llamaría Gedō Mazō y con el inmenso Chakra de este lograría proyectar el genjutsu en la luna donde todo el mundo lo vería. Después de ello en Amekagure Zetsu le presenta a Nagato quien posee los ojos originales de Madara y el único que puede controlar al Mazō. Es allí donde Obito se hace pasar por Madara y le habla del mismo sueño de la paz mundial, donde Yahiko no cree en sus palabras, "Madara" alega que Nagato con el tiempo entendería, des pues de ello en una aldea unos shinobis de Hanzō intentan atacar pero Nagato, Yahiko y Konan la defienden sin asesinar a nadie, poco tiempo después los tres huérfanos ya poseen bastantes seguidores y deciden llamar a la organización Akatsuki. 

Opcion 2

Opcion 3

"Estoy en el Infierno"

Obito se sigue recuperando en el escondite de Madara, allí se acostumbra poco a poco a el brazo implantado a partir del árbol de Hashirama por Zetsu y Zetsu remolino , ademas forja una amistad con ambos, pasado algún tiempo Obito recupera la mayoría de sus habilidades y su cabello crece, a este no le interesa el plan de Madara sobre el Tsukuyomi infinito. En algún momento Zetsu blanco le avisa que Kakashi y Rin están en gran peligro al enfrentarse a shinobis de Kirikagure, enseguida Obito intenta salir golpeando la roca pero no puede, Zetsu remolino lo envuelve y con ayuda de clones salen en la ayuda de Kakashi y Rin. Durante el camino Obito experimenta visiones de Rin y observa explosiones, cuando llega a la batalla conmocionado descubre que Kakashi con su Chidori asesina a Rin, ante esto Obito despierta su Kamui y también Kakashi pero este cae inconsciente y en un ataque de furia acaba con todos los shinobis de la neblina, una vez que termina todo se torna de sangre con lo que Obito alega que se encuentra en el infierno. 

Opcion 2

"Obito y Madara"

Madara que ha llegado a la batalla se prepara para capturar al Gyūki y Kurama, mientras que los Kages están gravemente heridos, Tsunade la única con pocas fuerzas invoca a Katsuyu para ayudar a los demás, Naruto libera a Gyūki de las estacas y su clon se lanza contra Madara lanzandole una Bijūdama pero Madara la absorbe con su abanico y usando el Uchihagaeshi le regresa el potente ataque. Kakashi le pregunta a Obito que es lo que le ha pasado, donde este empieza a recordar los momentos de cuando conoció a Madara y le salvo la vida, Obito aun débil decide volver a la aldea junto con los demás pero Madara alega que debe devolverle el favor pero Obito insiste en marcharse aun muy débil por perder medio cuerpo. Madara le explica que el quiere crear un mundo donde exista la verdadera paz, pero Obito no presta atención ya que su meta es volver a reunirse con Kakashi y Rin. 

Opcion 2